בשנת תשס"ה, כשהמקום כבר היה צר מלהכיל את התלמידים הרבים, נבנתה לבנין הישיבה קומה נוספת וכן הוכפל שטח בית המדרש.
בר"ח אלול תשס"ט, עם הגדלת הישיבה הגיע לכהן בראשות הישיבה מורינו הגאון רבי אברהם ישעי' פלס שליט"א.
במשך שנים רבות הרביץ תורה בישיבת אור אליעזר מורינו הגאון רבי אליעזר לוי שליט"א, עם הקמת הישיבה הגדולה של הישיבה הקד' בשנת תשע"ד, נתמנה לכהן פאר בהרבצת תורה בישיבה הקד'.