במהלך ימי בין הזמנים התקיימו ימי מנוחה בישיבות לצעירים שע"י הישיבה הקד' לאגירת כוחות ולחיזוק לקראת זמן אלול. במהלך ימי המנוחה התקיימו סדרי לימוד ושיעורים, ולאחר מכן התקיימו אירועים שונים, תוכניות ופעילויות לתלמידים נ"י, כשהנהלת הישיבה משקיעה רבות מאוד להצלחת ימי המנוחה.
ראש הישיבה הגרש"ב שליט"א, אשר עקב שהותו מעבר לים למען החזקת הישיבה הקד', נבצר ממנו להשתתף בחלק מימי המנוחה, כתב מכתב ברכה מיוחד לתלמידים בו הוא כתב: "לאהובי וחביבי תלמידי ישיבתנו הקד' נ"י. יהי רצון שתהא המנוחה כראוי ליגיעי כוח, מנוחת שלום ושלוה מנוחה שאתה רוצה בה, ותהא המנוחה כי טוב – ויט שכמו לסבול נועם עול עמל התורה בה אתם זוכים לעמוד לפני ה' ולעמול כל השנה כולה בתעצומות, ויהי רצון שתהא מנוחה זו לתוספת חיזוק כוח ועלייה, לקראת השנה הבאה בעז"ה".
בצל רבותיהם הגאונים ראשי ורבני הישיבות לצעירים שליט"א, זכו מאות התלמידים נ"י לשעות של קורת רוח ודברי חיזוק רוממות והתעוררות.
כמסורת תלמודי התורה שע"י הישיבה הקדושה בהעמדת חשיבות ענין החזרות, כדברי חז"ל כל הלומד ואינו שונה וכו', מידי שנה מתקיימות חזרות ומבחנים בכיתות ח' בתלמודי התורה שע"י הישיבה הקד' על החומר שנלמד במהלך השנה ובסוף השנה.
עם סיום לימוד פרק שלושה שאכלו במסכת ברכות, ולאחר חזרות רבות ושינון כל הפרק על כל סוגיותיו, תלמידי כיתות ח' בת"ת בני ברק – מרכז זכו לעלות למעונם של רבינו ראש הישיבה הגאון רבי חיים מרדכי אוזבנד שליט"א, ורבינו ראש הישיבה הגאון רבי שלום בער סורוצקין שליט"א, בקריית הישיבה, הם נבחנו על פרק שלושה שאכלו ועל פרק ראשון דברכות, יחד עם המנהל הרה"ג ר' יונה עמנואל שליט"א, והמלמדים הרה"ג ר' שלמה ישראלי שליט"א והרה"ג ר' יעקב ליבוביץ שליט"א.
רבותינו רה"י שליט"א בחנו את התלמידים במשך שעה ארוכה על כל הפרק מרישא ועד גמירא, ושיבחו מאוד את התלמידים ואת ידיעותיהם המופלגות בבהירות ובחדות. בסיום הדברים בירכו רבותינו רה"י את התלמידים שיזכו לגדול לתלמידי חכמים מופלגים לתפארת הוריהם מחנכיהם וכל בית ישראל.
חיזוק רב בתוכנית "משמרת השבת" בישיבה הקד' שנוסדה לפני תקופה ע"י כמה מבני החבורה נ"י, בהכוונת הגאון רבי יעקב ויינפלד שליט"א, התוכנית שזכתה לברכת רבותינו ראשי הישיבה שליט"א נועדה ללימוד וליבון הלכות שבת קודש, כשזמן הלימוד הוא בבין הסדרים בשישי ושבת קודש, ומידי שבוע מתקיימים מבחנים.
עם תחילת זמן חורף הצטרפו רבים מתלמידי הישיבה נ"י לתוכנית, כשעם החיזוק הרב אף נוסדה חבורה מידי מוצש"ק על הלכות שבת שנמסרת ע"י בני החבורה.
תלמידי כיתות ב' בתלמודי התורה שע"י הישיבה הקד' בעיר בית שמש, בסניפים רמה ד' ורמה ג', זכו לעלות יחד עם המנהלים, המפקח והמלמדים שליט"א למעונם של רבינו ראש הישיבה הגאון רבי חיים פינשטיין שליט"א והגה"צ רבי שמעון גלאי שליט"א, לרגל התחלת לימוד המשניות. מרנן ורבנן שליט"א נשאו דברי חיזוק והרעיפו ברכות על התלמידים ואף חילקו לתלמידים מיני מתיקה, ובירכו שיזכו להרגיש במתיקות התורה כל חייהם, ללמוד ולעסוק בתורה הקדושה.
מעמד רב רושם נערך בחדר האוכל בישיבה הקד', ברוב הוד והדר לכבודה של תורה, לרגל מעמד סיומי מסכתות בבא מציעא, בבא קמא, קידושין, מכות, נזיר, עבודה זרה ותענית, ע"י הבחור החשוב יחיאל יוסף פולק הי"ו. המעמד התקיים בהשתתפות רבינו ראש הישיבה הגרש"ב סורוצקין שליט"א שאף נשא דברים והאריך בחשיבות ניצול הזמן, לאחר הסיום רקדו בני ועד ג' לכבודה של תורה בליווי כלי זמר, את המעמד חתם אביו הגאון ר' מאיר טוביה פולק שליט"א שהאריך בעצות ובדרך לשקיעות בלימוד ובניצול הזמן.